Cefotaxím je určený na liečbu infekcií spôsobených baktériami citlivými na cefotaxím:
- Infekcie dýchacích ciest
- Urogenitálne infekcie (infekcie močových ciest a pohlavných orgánov)
- Septikémia, bakterémia (otrava krvi, rozšírenie infekcie)
- Endokarditída (zápal vnútrosrdcia)
- Vnútrobrušné infekcie vrátane peritonitídy (zápal pobrušnice)
- Meningitída (zápal mozgových blán)
- Infekcie kostí a kĺbov
- Infekcia kože a mäkkých tkanív.

Dávkovanie, spôsob podania a interval medzi dvomi nasledujúcimi dávkami závisí od závažnosti infekcie, citlivosti vyvolávajúceho mikroorganizmu a stavu pacienta. Cefotaxím sa môže podávať intravenózne alebo intramuskulárne. Intravenózne použitie: 1 g liečiva sa rozpustí v 4 ml, 2 g liečiva sa rozpustia v 10 ml vody na injekciu. Roztok sa aplikuje pomaly 3 – 5 minút. Vyššie dávky cefotaxímu sa podávajú i.v. infúziou: 2 g cefotaxímu sa rozpustia buď v 40 ml vody na injekciu (na krátkodobú infúziu) alebo v 100 ml fyziologického roztoku, 0,9 % roztoku chloridu sodného, v 5 % roztoku dextrózy alebo v inom vhodnom infúznom roztoku (okrem hydrouhličitanu sodného) na dlhodobú infúziu. Krátkodobá infúzia (2 g v 40 ml) sa podáva 20 minút. V dlhodobej infúzii sa podávajú 2 g cefotaxímu v 100 ml fyziologického roztoku alebo glukózy počas 50 – 60 minút. Intramuskulárne použitie: 1 g liečiva sa rozpustí v 3 ml, 2 g liečiva sa rozpustia v 5 ml vody na injekciu. Roztok sa aplikuje hlboko do sedacieho svalu.
Dávkovanie: Dospelí - nekomplikované infekcie: 1-2 g každých 12 hodín; stredne ťažké infenkcie: 1-2 g každých 8 hodín; ťažké infekcie: 2 g každých 8, 6 alebo 4 hodiny. Deti (1 mesiac až 12 rokov) do hmotnosti 50 kg - dávka 100-200 mg/kg/deň rozdelená na 3-6 jednorazových dávok, podľa závažnosti infekcie. Novorodenci - (1-4 týždne): 50 mg/kg každých 8 hodín (0-7 dní): 50 mg/kg každých 12 hodín Najvyššia denná dávka nesmie presiahnuť 12 g, u detí 200 mg/kg/deň. Pri renálnych poruchách musíme dávkovanie prispôsobiť stupňu poškodenia obličiek. Pri začínajúcej anúrii (klírens kreatinínu 5 ml/min) dávku cefotaxímu znížime na polovicu.